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Fiche détaillée d'un cours
 | Bioinformatique | ||
2023-2024 | FrFaculté de Gestion, Economie & Sciences Licences
(
FGES LICENCES
)
| ||
Code Cours : | 2324-FGES-COMP-FR-3003 | ||
| Niveau | Année de formation | Période | Langue d'enseignement |
|---|---|---|---|
| FrFrançais |
| Professeur(s) responsable(s) | MARIE JOE KARAM KASSAR |
|---|---|
| Intervenant(s) | Pas d'autre intervenant |
- Ce cours apparaît dans les formations suivantes :
- Faculté de Gestion, Economie & Sciences - Licences & Prépas - Licence 3 Sciences de la vie - S5 - 2 ECTS
Pré requis
Pour suivre ce cours, l'étudiant doit avoir des connassances en :
- Biochimie
- Biologie moléculaire
- Biotechnologies
- Connaissance du Web
Objectifs du cours
A la fin du cours, l'étudiant devrait être capable d'appliquer des méthodes d'analyse bioinformatique permettant d'extraire les informations utiles d'une séquence d'un génome.
Contenu du cours
Intruduction : la bioinformatique, c'est quoi ?
Chapitre 1 : Les bases de données
Historique; Organisation; Systèmes d'interrogation dédiés (entrez, SRS, entrée SWISS-PROT)
Chapitre 2 : Design d'amorces
Méthodologie et logiciels (NetPrimet; Primer3; PerlPrimer)
Chapitre 3 : Analyses de séquences
Recherche de motifs dans les bases de données; Alignement de séquences par paires ou multiples, Notions de similitude; Systèmes d'interrogation dédiés (BLAST, CLUSTAL ...)
Chapitre 4 : Prédiction et modélisation moléculaire
Utilisation de PDB (Protéine Data Bank); Structure 3D; Phylogénie moléculaire
Modalités d'enseignement
Organisation du cours
Méthodes pédagogiques
Évaluation
Travaux Pratiques : coeff. 1
Bibliographie
Gilbert Deléage et Manolo Gouy, Bioinformatique : Cours et cas pratique, Collection : Sciences Sup, Dunod
Ressources internet
* Informations non contractuelles et pouvant être soumises à modification
